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鲤鱼完整基因组序列图的完成

研究小组完成了深度基因组测序, 雌性鲤的精细定位和基因组注释

鲤鱼完整基因组序列图的完成,这标志着鲤鱼重要经济性状的遗传分析和遗传选择已进入基因组时代。首次, 绘制了鲤的单碱基分辨率基因组遗传变异图。

鲤鱼是世界上分布最广泛的养殖经济鱼类之一。它还为研究脊椎动物基因组进化和基因衍生机制提供了有价值的数据和模型,为了进行全基因组的选择性育种,它为培育新的优质鲤鱼品种奠定了坚实的基础,具有重要的理论意义和应用价值。此外,通过全基因组多态性扫描和比较转录组分析,遗传位点 确定并定位了与性状相关的功能基因和调控途径,例如缺失鳞片和确定鲤鱼的体色。分子时钟证据表明,鲤鱼基因组的四倍大约发生在8。

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。鲤鱼基因组由100条染色体组成,它是完成了全基因组测序的脊椎动物中染色体数量最多的物种。

研究小组从基因组规模证实了鲤鱼基因组的异四倍体特征及其独特的全基因组复制事件。 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所8日发布,该研究所的孙晓文研究员领导的国际合作研究小组,完成鲤鱼基因组序列图的定位,并揭示其独特的全基因组复制事件,这是世界上第一个已完全解析的异源四倍体骨鱼类基因组图。分析重要经济性状(例如鲤鱼生长, 质量, 抗病性 和抗压力。该研究小组还对来自全球10个代表性菌株(种群)的33条鲤鱼进行了基因组重测序研究。这是迄今为止在脊椎动物中发现的最新的全基因组倍增事件。200万年前。是中国代表性的淡水养殖鱼类,它是最有资格使用基因组资源进行品种改良的水产养殖物种。由9亿个基地组成,包含52610个功能基因,大多数骨鱼的基因数量大约是其两倍。该研究结果最近发表在《自然遗传学》(nature genetics)杂志上。它的基因组由16个组成。